大埤鄉北有大湖口溪，西有北港溪，南有華興溪、三疊溪流貫其間，地勢由東向西漸次傾斜，坡度極為平緩。整體而言，全鄉地形為平緩且遼闊的平原地形。本鄉地質屬於河川近代沖積地，土質屬於微酸性至微鹼性的沖積土，其母岩為第三紀之砂岩，土質肥沃適宜農耕。
本鄉位於濁水溪以南，北迴歸線以北，年平均溫度為攝氏20~28度，年降雨量約1500~2000公厘。由於位於台灣西南部平原區，其氣候受緯度與暖流影響，屬典型亞熱帶氣候。雨季主要分布在五至九月，每年十至翌年一月為乾旱期。由於夏季西南季風與氣溫高，雲層較低易形成對流作用，因此五至九月易形成雷陣雨與颱風，帶來旺盛西南氣流，雨水充沛。